More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0779 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
754 aa  1513    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.89 
 
 
1559 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.59 
 
 
1085 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.07 
 
 
716 aa  440  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1103  histidine kinase  53.42 
 
 
531 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.458922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.07 
 
 
696 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.03 
 
 
689 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 
773 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 
745 aa  340  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
806 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
663 aa  317  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
657 aa  312  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
657 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
955 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
652 aa  288  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
652 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1235  histidine kinase  43.36 
 
 
573 aa  284  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
865 aa  280  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
720 aa  273  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
708 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
1331 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3575  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 
735 aa  261  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
680 aa  261  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
696 aa  259  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1501 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
1391 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 
1808 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1478 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
889 aa  251  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
882 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
824 aa  246  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
1965 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1297 aa  243  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1068 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1002 aa  241  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
773 aa  241  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
934 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 
701 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
606 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
1419 aa  238  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
1369 aa  233  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
628 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1287 aa  231  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1548 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
989 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
1431 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.97 
 
 
1220 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1330 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
989 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
697 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
1557 aa  223  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
663 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
835 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  34.03 
 
 
676 aa  220  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
1184 aa  220  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.98 
 
 
1399 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
519 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
796 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.59 
 
 
1371 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.56 
 
 
1407 aa  217  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.49 
 
 
1214 aa  217  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
881 aa  216  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1287 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
973 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  31.85 
 
 
678 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.36 
 
 
1453 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
1075 aa  213  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  35.75 
 
 
725 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
587 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1287 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
678 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
631 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
930 aa  211  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
791 aa  211  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  37.84 
 
 
1131 aa  208  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
653 aa  207  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
870 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
662 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.89 
 
 
1380 aa  205  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 
767 aa  205  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
1059 aa  203  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
760 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  32.07 
 
 
589 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
846 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  33.21 
 
 
742 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
1222 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  30.37 
 
 
685 aa  201  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
703 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
1313 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
1058 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
730 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
1177 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
866 aa  198  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 
1223 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
765 aa  197  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.04 
 
 
1348 aa  197  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.11 
 
 
1199 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.95 
 
 
772 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.79 
 
 
1361 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>