More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2933 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
806 aa  1612    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.59 
 
 
689 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.43 
 
 
657 aa  323  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
1085 aa  317  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 
657 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
663 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
754 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 
652 aa  300  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
652 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 
1559 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1103  histidine kinase  45.66 
 
 
531 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.458922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.31 
 
 
696 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
889 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 
716 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 
773 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1235  histidine kinase  45.77 
 
 
573 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3575  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.3 
 
 
735 aa  273  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
955 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.59 
 
 
1214 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
882 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.81 
 
 
1220 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
934 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
720 aa  238  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
745 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 
1557 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
865 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
1548 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
1297 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
1419 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
1223 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
796 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1501 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
701 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
1965 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
1431 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1478 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
708 aa  221  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
653 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
835 aa  220  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4861  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
687 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
1068 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
628 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
703 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
1391 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 
680 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
1330 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.12 
 
 
1399 aa  214  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  36.62 
 
 
676 aa  213  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
678 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
631 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.5 
 
 
1361 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
1084 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
1331 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
1808 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
697 aa  210  8e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
898 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.34 
 
 
1380 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
662 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
1222 aa  208  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
866 aa  208  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1287 aa  208  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
940 aa  208  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
844 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 
585 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 
764 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
663 aa  205  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  33.02 
 
 
678 aa  204  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
654 aa  204  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
529 aa  204  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  37.14 
 
 
725 aa  204  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
776 aa  203  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
947 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
696 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
776 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.73 
 
 
1348 aa  202  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1184 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1002 aa  201  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.2 
 
 
1408 aa  202  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  39.18 
 
 
633 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
776 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
587 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 
633 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
526 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
844 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
1007 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
1358 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
660 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
1287 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
530 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
761 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 
738 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
456 aa  197  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
761 aa  197  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.64 
 
 
882 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
881 aa  197  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  35.79 
 
 
651 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
896 aa  196  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.57 
 
 
1233 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
930 aa  196  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1088 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>