More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3575 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3575  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
735 aa  1481    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.8 
 
 
689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1235  histidine kinase  48.68 
 
 
573 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.63 
 
 
652 aa  291  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.59 
 
 
652 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.54 
 
 
773 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 
663 aa  280  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.65 
 
 
806 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1103  histidine kinase  43.03 
 
 
531 aa  276  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.458922  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 
657 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
657 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 
696 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
1559 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
754 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 
1085 aa  253  8.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
716 aa  241  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
882 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1557 aa  233  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
701 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
1297 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
1431 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
1287 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
1548 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
889 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
1965 aa  227  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 
934 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
730 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  35.83 
 
 
742 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
1808 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 
745 aa  224  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
1419 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
680 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
760 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1184 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
720 aa  214  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  37.68 
 
 
725 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.41 
 
 
1399 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
708 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
865 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
585 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
1002 aa  211  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1478 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
1331 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
1330 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1068 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
639 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
796 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
530 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1501 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
696 aa  207  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
955 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
530 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
628 aa  205  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
519 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
1391 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
844 aa  204  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  36.76 
 
 
1131 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
587 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.01 
 
 
1380 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
1287 aa  202  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
529 aa  201  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
633 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
631 aa  200  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
678 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
526 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.89 
 
 
1407 aa  199  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
526 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  30.9 
 
 
1015 aa  198  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.37 
 
 
823 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
528 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
528 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  34.78 
 
 
633 aa  197  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
633 aa  197  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  35.48 
 
 
755 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
752 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
776 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.91 
 
 
1371 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
539 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
1222 aa  195  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
844 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
824 aa  193  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
703 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
664 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
866 aa  192  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
776 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  36.36 
 
 
676 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.7 
 
 
1698 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.99 
 
 
1218 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
765 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
623 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
816 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.91 
 
 
1242 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  35.92 
 
 
1384 aa  191  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
835 aa  190  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
845 aa  190  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
657 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
738 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
930 aa  188  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  36.26 
 
 
741 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>