More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1235 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1235  histidine kinase  100 
 
 
573 aa  1151    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.69 
 
 
689 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.97 
 
 
773 aa  312  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
1085 aa  312  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3575  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.21 
 
 
735 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.09 
 
 
696 aa  306  9.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
754 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 
1559 aa  299  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.42 
 
 
806 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
657 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 
663 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1103  histidine kinase  44.73 
 
 
531 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.458922  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 
657 aa  289  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
652 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
652 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.7 
 
 
745 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
955 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
716 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
708 aa  250  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
1478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
882 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
865 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
1419 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 
701 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
1965 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 
1297 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
720 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
1548 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
1184 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 
889 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
1557 aa  226  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
1391 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
934 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
760 aa  223  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
1287 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
585 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
678 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.75 
 
 
1399 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
631 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1068 aa  220  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
1331 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1330 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  39.64 
 
 
676 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  33.15 
 
 
742 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
628 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1002 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
680 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
866 aa  217  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
697 aa  217  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  37.26 
 
 
1131 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
730 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
1808 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
696 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.2 
 
 
1407 aa  212  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1431 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
660 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  38.38 
 
 
725 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
796 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
526 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1223 aa  206  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  35 
 
 
678 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  38.1 
 
 
547 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
844 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
835 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  35.77 
 
 
1384 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  37.89 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.66 
 
 
1361 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
660 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
844 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1274 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
606 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 
663 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
1287 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1084 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.98 
 
 
1380 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
824 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.81 
 
 
1408 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
519 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
816 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
776 aa  193  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.03 
 
 
1214 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.13 
 
 
1371 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
653 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.99 
 
 
1152 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
662 aa  191  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  37.37 
 
 
755 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  31.44 
 
 
1015 aa  190  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
738 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
526 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
776 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.46 
 
 
1348 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
940 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
703 aa  189  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
776 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  38.42 
 
 
714 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
653 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
869 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
774 aa  187  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>