21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3223 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3223  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  950    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  0.039169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  35.94 
 
 		 966 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3334  hypothetical protein  34.43 
 
 		 483 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.920069  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  31.29 
 
 		 581 aa  186  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3659  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  30.85 
 
 		 754 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3640  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  29.97 
 
 		 756 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0350459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3103  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  29.14 
 
 		 763 aa  120  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3285  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 760 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000203475  normal  0.48487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0255  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  29.77 
 
 		 740 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.651298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3275  leucyl-tRNA synthetase class Ia  25.42 
 
 		 892 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0104078 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11518  putative alginate lyase precursor  27.62 
 
 		 771 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3274  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  28.14 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000152835  hitchhiker  0.00641941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2066  alginate lyase precursor  28.46 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  30.86 
 
 		 768 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0789  hypothetical protein  23.29 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  25.38 
 
 		 1554 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  30.95 
 
 		 1755 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2044  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.91 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.039257  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.47 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  42.03 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3335  hypothetical protein  26.13 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>