More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12321 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_12321  ABC transporter for amino acids, substrate binding protein  100 
 
 		 349 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0921639  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1168  extracellular solute-binding protein  94.27 
 
 		 349 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0614  extracellular solute-binding protein  78.8 
 
 		 353 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14271  extracellular solute-binding protein  78.8 
 
 		 353 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12151  ABC transporter for amino acids, substrate binding protein  69.34 
 
 		 349 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0847  extracellular solute-binding protein  63.87 
 
 		 367 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1809  extracellular solute-binding protein  65.22 
 
 		 353 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0246  extracellular solute-binding protein  52.6 
 
 		 359 aa  355  5e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14791  hypothetical protein  75.35 
 
 		 215 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.667997  normal  0.0481257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1998  extracellular solute-binding protein  49.39 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4667  extracellular solute-binding protein family 3  51.23 
 
 		 364 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0740  extracellular solute-binding protein  48.29 
 
 		 356 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2522  family 1 extracellular solute-binding protein  47.14 
 
 		 355 aa  330  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2086  extracellular solute-binding protein family 3  49.38 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2062  extracellular solute-binding protein family 3  49.38 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0715  extracellular solute-binding protein family 3  48.76 
 
 		 362 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.337122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1454  extracellular solute-binding protein  47.98 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4005  extracellular solute-binding protein  47.35 
 
 		 389 aa  312  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0338  extracellular solute-binding protein family 3  45.35 
 
 		 389 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000810551  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2071  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0757625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2832  extracellular solute-binding protein family 3  44.58 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2549  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  44.19 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216585  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2558  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  44.38 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3923  putative amino-acid ABC transporter, substrate-binding protein  46.08 
 
 		 338 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3560  extracellular solute-binding protein  43.12 
 
 		 342 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.801082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1004  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  43.16 
 
 		 340 aa  295  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2912  extracellular solute-binding protein  44.92 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.392971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1113  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.3 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1760  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.69 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4546  extracellular solute-binding protein  44.83 
 
 		 336 aa  291  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6377  extracellular solute-binding protein family 3  43.53 
 
 		 337 aa  291  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1563  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.61 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1529  extracellular solute-binding protein  42.73 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1705  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.74 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.402619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5870  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.76 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4393  extracellular solute-binding protein  43.51 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4552  extracellular solute-binding protein  40.98 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1108  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.04 
 
 		 341 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0904  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.700259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1072  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1297  general amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.62 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2822  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  42.81 
 
 		 337 aa  278  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0229  extracellular solute-binding protein family 3  39.94 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0120  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4587  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.26 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1255  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.47 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0438  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3652  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.26 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3462  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.57 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3754  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.26 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.248765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3563  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.57 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3857  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4428  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 342 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2818  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  41.74 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3397  hypothetical protein  43.02 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167886  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0233  extracellular solute-binding protein family 3  39.63 
 
 		 341 aa  275  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2551  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  43.75 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3707  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371845 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02361  hypothetical protein  39.66 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3701  extracellular solute-binding protein family 3  38.15 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5283  extracellular solute-binding protein family 3  40.06 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0975  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.43 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0561977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003418  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  40.23 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.49248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1747  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.09 
 
 		 338 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.913718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1602  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.88 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0393  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.09 
 
 		 338 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0323019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1406  extracellular solute-binding protein  41.07 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4094  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0267267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03126  predicted amino-acid transporter subunit  40.39 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1640  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2557  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.79 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03077  hypothetical protein  40.39 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2503  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.66 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2136  extracellular solute-binding protein  41.88 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204406 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0948  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.18 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.18 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2057  general L-amino acid-binding periplasmic protein precursor  41.74 
 
 		 342 aa  268  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14100  putative amino acid-binding protein  39.17 
 
 		 341 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.111954  normal  0.0628834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4673  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2324  extracellular solute-binding protein  42.41 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0741  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.48 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0736  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.48 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3606  extracellular solute-binding protein  41.19 
 
 		 345 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0973  extracellular solute-binding protein  41.61 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.846042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0627  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  39.89 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4382  extracellular solute-binding protein  40.58 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.98504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4484  extracellular solute-binding protein  40.25 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3679  extracellular solute-binding protein  36.81 
 
 		 345 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1695  extracellular solute-binding protein  41.72 
 
 		 411 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0207768  hitchhiker  0.000479364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2892  extracellular solute-binding protein  39.49 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0042428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1420  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217844  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4179  extracellular solute-binding protein family 3  40.57 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3988  extracellular solute-binding protein family 3  40.25 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1253  putative amino acid-binding protein  38.36 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2579  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171917  normal  0.200935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0793  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.38 
 
 		 341 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  39.89 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2984  extracellular solute-binding protein  41.62 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2946  extracellular solute-binding protein family 3  39.5 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0705  general L-amino acid-binding periplasmic protein  38.02 
 
 		 345 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>