More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0010 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  850    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  39 
 
 		 1462 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  37.1 
 
 		 833 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  41.18 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  36.44 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  47.62 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  35.01 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  46.7 
 
 		 351 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  44.15 
 
 		 530 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  44.62 
 
 		 319 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  35.45 
 
 		 792 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  41.21 
 
 		 232 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  34.66 
 
 		 950 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  45.4 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  42.57 
 
 		 220 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  39.15 
 
 		 477 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  42.13 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  43.39 
 
 		 207 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  43.16 
 
 		 207 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  40.64 
 
 		 526 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  42.16 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  38.14 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  38.16 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  35.32 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  32.74 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  38.99 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  40.54 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  44.3 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  29.49 
 
 		 1043 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  42.53 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  28.64 
 
 		 767 aa  104  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  40.94 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  41.67 
 
 		 346 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  36.89 
 
 		 641 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  36.72 
 
 		 340 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  43.26 
 
 		 1050 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  36.65 
 
 		 493 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  35.75 
 
 		 364 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  37.14 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  29.72 
 
 		 854 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  42.66 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  36.11 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  42 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  38.51 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  34.78 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  41.96 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  40.23 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  40.27 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.98 
 
 		 3619 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.85 
 
 		 3619 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  39.71 
 
 		 1503 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  36.76 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  33 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  38.73 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  34.71 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  36.17 
 
 		 743 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  41.86 
 
 		 2667 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  38.03 
 
 		 594 aa  73.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  35.18 
 
 		 3608 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  40.98 
 
 		 1814 aa  73.2  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  35.17 
 
 		 266 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.27 
 
 		 1795 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  35.17 
 
 		 266 aa  72.8  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  32.07 
 
 		 738 aa  72.4  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  34.97 
 
 		 848 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  33.74 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.84 
 
 		 2105 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.01 
 
 		 4334 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.71 
 
 		 3427 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  47.56 
 
 		 1383 aa  70.5  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40 
 
 		 813 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.84 
 
 		 5098 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  37.63 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.56 
 
 		 1963 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.35 
 
 		 1553 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  40.15 
 
 		 679 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.64 
 
 		 1424 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.67 
 
 		 1236 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 		 518 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  56.67 
 
 		 5218 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.57 
 
 		 1279 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  34.52 
 
 		 4723 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  40.56 
 
 		 2954 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.3 
 
 		 2346 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  42.35 
 
 		 2784 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  33.75 
 
 		 2329 aa  63.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  55 
 
 		 5962 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  36.91 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.09 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  42.48 
 
 		 585 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  37.37 
 
 		 998 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  33.67 
 
 		 1421 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  41.07 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  42.48 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  49.45 
 
 		 850 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  34.59 
 
 		 942 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  28.66 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003092  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0245591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1518  hypothetical protein  34.13 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal  0.167707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>