Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Suden_1716 |
Symbol | |
ID | 3762743 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Sulfurimonas denitrificans DSM 1251 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_007575 |
Strand | - |
Start bp | 1796234 |
End bp | 1799023 |
Gene Length | 2790 bp |
Protein Length | 929 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 38% |
IMG OID | |
Product | hemolysin-type calcium-binding region |
Protein accession | YP_394226 |
Protein GI | 78777911 |
COG category | |
COG ID | |
TIGRFAM ID | |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 15 |
Plasmid unclonability p-value | 0.852019 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | n/a |
Fosmid unclonability p-value | n/a |
Fosmid Hitchhiker | n/a |
Fosmid clonability | n/a |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGCCTGCAA ATGGTTCTGG TACAAGAACT CAAAGTGATG TTACAGTAAC TGGTGGTAAT AACACAACAA CTGTAACTGT AAACCAAGAC GCTGCTGTTA CTGCTGTTGA TGCTGTTGAT GCTGTTGCTG GTGCTAACGA GACTGCAACA GTTGTTTTCA GTGCATTAAC TATTGGTCAA ACAGTTATCC TTGATGGTTT AACTTTTACT GCTTCTGCGG CTATGACTGC AACTGAAGCT GCAACAATAT TCGAAAATTT AGCAGCTGGT GCTACTCATG GTGCAGCAAC TAAAGGTGTC TATACAGGTG CATTAAGTTC AGACTATACA ACAGGTGCCG TGAGTGGTAC AAGCAGTAAT ACTGTTGTAT TTACAAGCGT TGTTAAAGCA AATGATGGAA CTAATATAGC AAATACTGGT ACTGGTACAG CTGCTGTAAC TGTTGTGAAT GGTTCAAGTG CAACTACTGC AGTAACTGGT GTTGCTGGTA TCGTTGGTGG TGCTGTTGTT ATTGCTGATG GTGCTACTAC TACAGACACA ATTGCAACTG TAACTCTTGA TGGATATGGT GCATCATCTA CAATTACTTC TGATGCATTA ACAACATTAA GCATTGCAAA TAGTGCTCAA GACCTTACAA TAACAAATGC TACAGCTACA ACTTTAGCTC TTACTGTTGA TAATGTAACA GCAGGTTCAG TTGTTGATGA TAATTCTGGT ACATATACTA CAATTAACAT CACTACAGCG AATGCAGATT CTGATATTGA TTTAGATGCT GCTGCAGCAA CTACATTAAC TGTAGCTGGA ACAAATGCAC TTGATTTAAC AGGCGCAACT TTGACTGCAC TTACTACATT AACAGTTTCT GGTTCTGCTA GTTTAACTAT GGATGGAGAT GAGGCAGATA CGCTTACATC TGTAAACACA TCTGCTACAA CTGGTACAAC TACAATCACA ATCGGTGGTG ATACTGCAAC ATATACTGGT GGAGCTGGTG TTGATAATGT AACTTTGGAT AGTACTACAG TTAACAAAGC TATCAACTTA GGTGCTGGAA ATAACTCATT AACTCTTGCA ACAGGTACTA CATCATTAAC AACCGAAATG ATTGCTGGCA GTGGAACAGA TACATTAGTT ATGGCGTCTG CTGATGCGAT TACTGCAAGT AGTACTACAG TTTTTGAAAC TAAAATCACA GGATTTGAAA AGTTAAGCTT AGGTGCGAAC ACAACAACTG GTACAGTTGA CTTAGCTAAT ATGGATGATA TGAGTTATGT AGTAAGTGCA AACTCTGCAG CTGGTGCAGA AATTCAAACA TTTACAATCA CTCATGGAAC AGATGCTGAA GTAGCTGAAG TTCAAACATT TACTACTACA GGTTCAACAG GTGCCGGTAC AGCTGTAGTT GCTGGCGTAA ATGTTGCAAT TGGTGGAGCA TTAACAGCTG ATCAAGTTGG TGCATTAATT GCTGCTGAAG ATTATTCTGG AAATGCTAAT ATAAGTTCTG TTACATATTT AGGTGGTATA GTTCGTATTA CTTATACTAC TGCTGCAGGT GACCAAGCTG CTGCTGTAAT CAATGATGAT AATGGAAATA CTGGAATCGT TTTTGGTGCA GTGTTAGATA ATGCTGTAGC GTACGATTCA AACACTGGTA ATATCGCTAT TGAAGGTGTG AATGTTGCTG TTGCTGCTGA TCTTACAGCT GATCAAGTTG GTGCATTAAT TACTGCTGCA GATTATTCAA GTACAACAAT TGCATCTGTT GCATATAACA GCACTACTGA CACAGTAACC GTAACATATG ATGCTGGTGT TAATGAAGCT GCTACAACAG CTGTTGATAC TGATACGACT GGTGTTGCTT TTGGTTCAAT TACAACAACT GTTGATGGTT CAGCTACGAC TGCATTAACT CTTGATAACA TGGCTAATAA TGGTACTTTA GAGCTAACAG CAGCTGGTTC AGGTGTTGTT GTAACTATGG ATGACGCTAC AAGTACAACT GCAGATATTT TTAATATTTT ATTAAGTACA AATACAAATG GTACTGTTGC TATGGGTACG GTAAGTGTAG CTGGTGTTGA AACAATTCAT ATCACTACTG CAGATACAAA CACAGCTTCA ACTGATTCAA ATGTGCCTGC ATATACTATG ACTTTAAGTG ATGCTGCAGT TAAAACTATG ACTATCTCAG GTAATGCTGC ATTAACGCTT ACAAATACAG ATAATGTTGC GTTAACTTCA CTTAATGCTT CAAGTATGAC TGCTGCATTG ACAGCAACTA CAAACGGTAC AGTAGCTGAA ACAATCACTG GTGGTTCAGG AAATGATGTG TTAACTACAT CTAAATCTGG AGATGTTCTA ATCGGTGGCG AAGGAAATGA TACTTTAACA GGTACAGAAC TTGTAACATT AACTGGTGGG GCAGGTAATG ATATATTTGT TGCTGATACA GTTTCATCAA ATGTTAACAG CTATATGACA ATTACAGATG CAACTGCTGG TGATTACATC AAATTTACTG GTGCGGATTC ATTCGCAAGC TCTGCTGTTG AACTTGGTAG TACTGCAGTA TTCCAAGACT ATGCAAATGA AGCAATTAAC TTAATTGGTG CTAATGATAT TGCATGGTTC CAATTTGATG GAAATACATA CCTTGTTATG GATAAAACAG ATACAACTGT ATTTACAGAA AATCAAGATG TTATTGTTAA ATTAACAGGT CTTATAGATT TAAGTACTGC AACATTTAAC GATACAGCAG ATACTATCCA ACTATTCTAA
|
Protein sequence | MPANGSGTRT QSDVTVTGGN NTTTVTVNQD AAVTAVDAVD AVAGANETAT VVFSALTIGQ TVILDGLTFT ASAAMTATEA ATIFENLAAG ATHGAATKGV YTGALSSDYT TGAVSGTSSN TVVFTSVVKA NDGTNIANTG TGTAAVTVVN GSSATTAVTG VAGIVGGAVV IADGATTTDT IATVTLDGYG ASSTITSDAL TTLSIANSAQ DLTITNATAT TLALTVDNVT AGSVVDDNSG TYTTINITTA NADSDIDLDA AAATTLTVAG TNALDLTGAT LTALTTLTVS GSASLTMDGD EADTLTSVNT SATTGTTTIT IGGDTATYTG GAGVDNVTLD STTVNKAINL GAGNNSLTLA TGTTSLTTEM IAGSGTDTLV MASADAITAS STTVFETKIT GFEKLSLGAN TTTGTVDLAN MDDMSYVVSA NSAAGAEIQT FTITHGTDAE VAEVQTFTTT GSTGAGTAVV AGVNVAIGGA LTADQVGALI AAEDYSGNAN ISSVTYLGGI VRITYTTAAG DQAAAVINDD NGNTGIVFGA VLDNAVAYDS NTGNIAIEGV NVAVAADLTA DQVGALITAA DYSSTTIASV AYNSTTDTVT VTYDAGVNEA ATTAVDTDTT GVAFGSITTT VDGSATTALT LDNMANNGTL ELTAAGSGVV VTMDDATSTT ADIFNILLST NTNGTVAMGT VSVAGVETIH ITTADTNTAS TDSNVPAYTM TLSDAAVKTM TISGNAALTL TNTDNVALTS LNASSMTAAL TATTNGTVAE TITGGSGNDV LTTSKSGDVL IGGEGNDTLT GTELVTLTGG AGNDIFVADT VSSNVNSYMT ITDATAGDYI KFTGADSFAS SAVELGSTAV FQDYANEAIN LIGANDIAWF QFDGNTYLVM DKTDTTVFTE NQDVIVKLTG LIDLSTATFN DTADTIQLF
|
| |