219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2041 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2041  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  777    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  40.99 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4543  glucose sorbosone dehydrogenase  40.89 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  39.59 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  37.08 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1990  hypothetical protein  30.77 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  30.55 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  29.48 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  29.27 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  34.71 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  27.92 
 
 		 394 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 369 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  31.7 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  30.6 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  29.65 
 
 		 375 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  31.59 
 
 		 387 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  32.75 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  26.42 
 
 		 422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  28.4 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  30.52 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  26.55 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  29.5 
 
 		 391 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  30.25 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  28.65 
 
 		 410 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 406 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  32.67 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  28.23 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  29.1 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  30.99 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  30.12 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  29.38 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  28.01 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.43 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.48 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  28.37 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.75 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.09 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.24 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.25 
 
 		 809 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 		 385 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 432 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.09 
 
 		 729 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  29.72 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  27.84 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  28.01 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  30.35 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.29 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  28.89 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  31.91 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.95 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  28.09 
 
 		 357 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  31.55 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  28.89 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.35 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  26.87 
 
 		 387 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  27.68 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  28.02 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  28.22 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  26.53 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  27.75 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  30.32 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  30.14 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  29.23 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.86 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  30.84 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  28.12 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 		 385 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  27.58 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  27.68 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  28.07 
 
 		 394 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  35.52 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  28.89 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  29.24 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  28.74 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.65 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  28.9 
 
 		 465 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  26.57 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  27.63 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  28.87 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  26.89 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  26.3 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  26.26 
 
 		 462 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  27.41 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  24.61 
 
 		 358 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  26.22 
 
 		 476 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  27.51 
 
 		 381 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  27.07 
 
 		 372 aa  93.2  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  27.78 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>