67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2868 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2868  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  724    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3234  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.86 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13021  lipoprotein lppZ  41.78 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1883  LppZ  40.6 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24433  normal  0.198327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1949  LppZ  40.6 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1903  LppZ  40.6 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4242  LppZ  43.05 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2119  LppZ  42.86 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08770  hypothetical protein  37 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6029  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.7 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  36.83 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.9 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  29.58 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.84 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  29.01 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  31.1 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  30.19 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  30.22 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  28.71 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  43.56 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.38 
 
 		 809 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  31.88 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  28.09 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  31.72 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  25.16 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  27.43 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.14 
 
 		 729 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  32.33 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  27.02 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  27.98 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.44 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.53 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  29.11 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  30.17 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  32.29 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  31.07 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  24.61 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  26.97 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  24.89 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  31.33 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  31.65 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  26.94 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  32.97 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  30.43 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  30.65 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.69 
 
 		 1657 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  24.87 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  25.39 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  27.42 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  24.87 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  24.87 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  24.87 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  24.87 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  24.87 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  24.87 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  24.87 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  26.81 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  24.43 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  28.24 
 
 		 382 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>