95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4242 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4242  LppZ  100 
 
 		 362 aa  725    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2119  LppZ  92.24 
 
 		 363 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1949  LppZ  83.66 
 
 		 391 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1903  LppZ  83.66 
 
 		 391 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1883  LppZ  83.66 
 
 		 391 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24433  normal  0.198327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13021  lipoprotein lppZ  78.89 
 
 		 394 aa  521  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3234  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.85 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08770  hypothetical protein  38.95 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6029  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.17 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2868  hypothetical protein  40 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  35.64 
 
 		 387 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  30.97 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  31.73 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  32.39 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.97 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  28.43 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  33.8 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  29.1 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  28.38 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29.25 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  28.15 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35 
 
 		 809 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  35.67 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  27.75 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  34.03 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  36.05 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  27.12 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.04 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  29.78 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  31.9 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  31.6 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.54 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  29.36 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  26.26 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  29.36 
 
 		 385 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.74 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.89 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  29.59 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  27.33 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  38.14 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  32.18 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  27.43 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  32.65 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  29.01 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  27.33 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  29.63 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  28.65 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  28.09 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  30.39 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  32.62 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  27.68 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  29.77 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  23.11 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  23.11 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  23.11 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  28.31 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  23.11 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  23.11 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  23.11 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  25.24 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  26.17 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  23.11 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  23.11 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 382 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.07 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  29.95 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  25.97 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  26.88 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  24.07 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  24.88 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1990  hypothetical protein  28.03 
 
 		 409 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  28.33 
 
 		 428 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  27.22 
 
 		 383 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  28.33 
 
 		 428 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  28.22 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  26.2 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  23.92 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.61 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.39 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  28.39 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  27.35 
 
 		 422 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4500  glucose sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0327398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4543  glucose sorbosone dehydrogenase  27.22 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  26.58 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  23.83 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  26.62 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  27.36 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  26.9 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  24.39 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  26.9 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  27.41 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  29.88 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  23.08 
 
 		 413 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>