240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0139 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  755    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.95 
 
 		 400 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4543  glucose sorbosone dehydrogenase  40.81 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2041  glucose sorbosone dehydrogenase  36.96 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  37.57 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  34.35 
 
 		 391 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  31.85 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  31.95 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1990  hypothetical protein  31.41 
 
 		 409 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660966  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  32.61 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  33.16 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  32.29 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  30.41 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  34.01 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.56 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.92 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  30.18 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  29.75 
 
 		 394 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  32.7 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  29.26 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  31.59 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.13 
 
 		 378 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  30.87 
 
 		 382 aa  132  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  29.21 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  32.97 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  28.73 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  34.4 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 		 388 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  28.82 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  29.02 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  30.61 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.56 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  29.4 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.14 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  30.55 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.14 
 
 		 382 aa  125  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  30.66 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  31.04 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  30.68 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  28.65 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  26.49 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  29.61 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  29.46 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  26.9 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  31.37 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  27.23 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  31.17 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  33.07 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  28.53 
 
 		 374 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  27.61 
 
 		 392 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  27.79 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  27.88 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  26.87 
 
 		 400 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  29.66 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  33.72 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  26.26 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  31.61 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  31.05 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  29.1 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  30.93 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  27.46 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.68 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.49 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  30.89 
 
 		 392 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  29.9 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  28.18 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  28.31 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  28.12 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  27.82 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  28.69 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  28.01 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  27.96 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  27.3 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  29.66 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  27.37 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  28.5 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  28.07 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  27.88 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  29.01 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  27.91 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 391 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  35.8 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  27.67 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  26.87 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.49 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  25.85 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  30.36 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  30.53 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  30.69 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.87 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  30.08 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  28.31 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>