139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6029 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6029  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 385 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08770  hypothetical protein  50 
 
 		 385 aa  339  4e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3234  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.42 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.94 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4242  LppZ  42.81 
 
 		 362 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1903  LppZ  43.15 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1949  LppZ  43.15 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1883  LppZ  43.15 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24433  normal  0.198327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2119  LppZ  46.12 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13021  lipoprotein lppZ  43.41 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2868  hypothetical protein  40.56 
 
 		 372 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  37.53 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  33.11 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  34.63 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  33.22 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  34.11 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.34 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  34.11 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.31 
 
 		 809 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  31.99 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  35.87 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  32.89 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  34.53 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  32.67 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  29.45 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  30.57 
 
 		 357 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.32 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  32.57 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  33.12 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  30.14 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  31.15 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  31.63 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  29.07 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  28.7 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  24.42 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  25.91 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  29.52 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  31.17 
 
 		 469 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  25.68 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  31.86 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  28.65 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  31.15 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.14 
 
 		 369 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.57 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  29.76 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  28.02 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  28.02 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  28.02 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.02 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  28.02 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.57 
 
 		 1657 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  29.65 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  28.42 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.04 
 
 		 729 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  27.47 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  27.47 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  35.37 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  27.87 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.42 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  31.46 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  29.28 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  30.21 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  27.07 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  30.04 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  29.25 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  34.38 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  27.37 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  31.05 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  31.53 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  25.84 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  29.86 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  27.62 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  27.32 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  28.4 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  24.88 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.19 
 
 		 430 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  31.97 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  25.77 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  27.17 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  24.53 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  27.37 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  28.73 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  26.97 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  26.98 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  24.73 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  30.51 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  29.14 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  27.98 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  31.31 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  27.59 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.4 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  27.59 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  25.13 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  27.1 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>