67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3234 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3234  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 365 aa  732    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1903  LppZ  46.58 
 
 		 391 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1949  LppZ  46.58 
 
 		 391 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1883  LppZ  46.58 
 
 		 391 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24433  normal  0.198327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2868  hypothetical protein  45.98 
 
 		 372 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4242  LppZ  44.85 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08770  hypothetical protein  37.83 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2119  LppZ  45.18 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13021  lipoprotein lppZ  45 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6029  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.7 
 
 		 385 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.51 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  32.73 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.92 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  32.89 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 		 381 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  32.36 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  30.52 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  30.75 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  31.46 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  32.32 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  30.43 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.37 
 
 		 809 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  28.9 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  30.27 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  36.09 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  30.25 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  28.74 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  26.67 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  26.91 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  24.64 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  26.59 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  23.94 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  27.3 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.58 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  25.82 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.97 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  29.58 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  29.58 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  28.4 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.03 
 
 		 374 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.03 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  24 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  29.54 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  28.44 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  24.73 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  26.11 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  28.12 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  26.38 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.9 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  26.38 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  26.38 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  26.38 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  26.38 
 
 		 371 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  26.38 
 
 		 371 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  26.38 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  26.91 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  29.88 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.86 
 
 		 1657 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  28.5 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  26.38 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  27.05 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  27.22 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  25.26 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>