232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1958 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1958  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 
497 aa  970    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.922706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  35.79 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  35.42 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.89 
 
 
407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 
442 aa  123  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  35.54 
 
 
388 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  36.6 
 
 
381 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  35.34 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  36.94 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  34.38 
 
 
399 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.72 
 
 
360 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  34.45 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  37.14 
 
 
394 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  40.41 
 
 
353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  33.5 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.5 
 
 
369 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  31.14 
 
 
377 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  42.21 
 
 
335 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  46.96 
 
 
357 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  38.36 
 
 
363 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.5 
 
 
809 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  39.77 
 
 
343 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  31.44 
 
 
374 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  47.32 
 
 
360 aa  103  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  32.71 
 
 
369 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  31.48 
 
 
389 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  30.38 
 
 
381 aa  96.7  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.05 
 
 
365 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.9 
 
 
729 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  46.36 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  35.95 
 
 
366 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  35.03 
 
 
410 aa  92  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  36.88 
 
 
342 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  46.15 
 
 
388 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  35.38 
 
 
405 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  33.15 
 
 
408 aa  86.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  34.78 
 
 
585 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  32.67 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  32.76 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  34.74 
 
 
368 aa  84  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  34.32 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  47.73 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  34.07 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  37.01 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  34.18 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  32.39 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.92 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  40 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  31.82 
 
 
1657 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  31.16 
 
 
394 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  38.82 
 
 
366 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  39.09 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.64 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  39.25 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  30.81 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  33.77 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  37.58 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  38.18 
 
 
377 aa  77  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 
432 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  34.18 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  40.74 
 
 
430 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  30.98 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  38.94 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  38.46 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  38.46 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  32.61 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  43.43 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  31.85 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  37.5 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  35.45 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  31.94 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  35.45 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  40.52 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 
395 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  38.05 
 
 
1029 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  31.95 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  41.12 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  40.4 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  38.1 
 
 
369 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  30.37 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  31.96 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  36.75 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  40.91 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  39.62 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  38.68 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  32.53 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  32.53 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  40.19 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  34.69 
 
 
392 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  39.22 
 
 
384 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  30.48 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  37.14 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>