246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0842 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 415 aa  857    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  57.66 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  55.59 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  50 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  49.37 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  53.39 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  52.57 
 
 		 407 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  50.54 
 
 		 377 aa  358  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  52 
 
 		 377 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  45.12 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  44.31 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  48.06 
 
 		 376 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  47.63 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  42.77 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  39.89 
 
 		 410 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  40.22 
 
 		 432 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  39.67 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  39.39 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  34.74 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  34.74 
 
 		 406 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  34.47 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  38.02 
 
 		 374 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.74 
 
 		 374 aa  225  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  34.3 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  37.75 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4500  glucose sorbosone dehydrogenase  35.96 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0327398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  36.54 
 
 		 392 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  37.27 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  34.54 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 		 392 aa  222  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  36.22 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  33.91 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  32.52 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  37.87 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  39.42 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  37.64 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  38.07 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  35.54 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  37.78 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  38.22 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  36.46 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  37.78 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  37.86 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  37.78 
 
 		 371 aa  216  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  38.48 
 
 		 406 aa  216  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  37.78 
 
 		 371 aa  216  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  37.86 
 
 		 381 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  37.78 
 
 		 371 aa  215  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  37.78 
 
 		 371 aa  215  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  37.78 
 
 		 371 aa  215  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  36.8 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  37.64 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  35.66 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  36.64 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  37.12 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  35.52 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  34.88 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  34.9 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  35.96 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  36.51 
 
 		 380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  36.69 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  37.03 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.98 
 
 		 391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  36.52 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  37.04 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  34.93 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  39.01 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  36.11 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  36.31 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  34.73 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  36.21 
 
 		 387 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  34.64 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  33.01 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  34.73 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  33.68 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 375 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  35.24 
 
 		 376 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  32.77 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  34.04 
 
 		 407 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  34.96 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.67 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  34.46 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  34.14 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  36.88 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  33.15 
 
 		 395 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  34.7 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  34.2 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  31.49 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  33.66 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  32.44 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  32.66 
 
 		 396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  33.05 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  35.67 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>