267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4500 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4500  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
408 aa  819    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0327398  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  47.06 
 
 
382 aa  348  9e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  46.65 
 
 
376 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  41.84 
 
 
377 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  43.77 
 
 
387 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  40.2 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  40.59 
 
 
379 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  41.64 
 
 
377 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  40.1 
 
 
377 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  41.32 
 
 
392 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  39.74 
 
 
388 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  38.92 
 
 
377 aa  252  9.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  39.43 
 
 
410 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  37.66 
 
 
374 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  37.78 
 
 
432 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  38.86 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.66 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  38.16 
 
 
428 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  38.16 
 
 
428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  36.32 
 
 
394 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  37.79 
 
 
387 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  37.31 
 
 
391 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  37.27 
 
 
382 aa  225  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  36.86 
 
 
383 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  36.62 
 
 
388 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  35.96 
 
 
415 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  35.66 
 
 
375 aa  223  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  35.89 
 
 
366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  38.9 
 
 
396 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  35.4 
 
 
397 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.68 
 
 
399 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  36.72 
 
 
396 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  34.63 
 
 
406 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  34.39 
 
 
400 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  36.17 
 
 
378 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  35.69 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  38.96 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  34.54 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  36.9 
 
 
413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  36.76 
 
 
430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  37.13 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  36.04 
 
 
391 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  31.57 
 
 
389 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  36.54 
 
 
369 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  37.12 
 
 
418 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  35.64 
 
 
392 aa  209  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.1 
 
 
391 aa  209  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.85 
 
 
406 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  35.9 
 
 
394 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  36.2 
 
 
392 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  33.25 
 
 
396 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.78 
 
 
412 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 
405 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  35.02 
 
 
397 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  35.28 
 
 
395 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  36.18 
 
 
395 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  34.95 
 
 
384 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  35.2 
 
 
360 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  33.95 
 
 
382 aa  203  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  34.24 
 
 
381 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  36.18 
 
 
415 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  35.31 
 
 
370 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  35.58 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  34.13 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  33.96 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  36.58 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  36.78 
 
 
402 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  32.26 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  34.64 
 
 
387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  34.4 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  33.96 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  31.78 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  36.13 
 
 
378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  34.66 
 
 
485 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  35.66 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  33.58 
 
 
388 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1619  glucose sorbosone dehydrogenase  36.41 
 
 
404 aa  196  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293091  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  33.5 
 
 
388 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  33.59 
 
 
380 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  35.2 
 
 
382 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.84 
 
 
379 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  35.68 
 
 
462 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  33.52 
 
 
392 aa  192  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  34.17 
 
 
392 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  33.16 
 
 
369 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  34.17 
 
 
392 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  33 
 
 
368 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  34.7 
 
 
465 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2626  glucose sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 
369 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.393801  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  35.6 
 
 
405 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  31.62 
 
 
466 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  34.05 
 
 
408 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  31.2 
 
 
405 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  33.58 
 
 
530 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  33.88 
 
 
383 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  34.13 
 
 
383 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  34.84 
 
 
378 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>