29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1179 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1179  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1254    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.952655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2872  Peptidase M64, IgA  27.01 
 
 
785 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3935  IgA peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M64  32.86 
 
 
510 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819698  normal  0.416212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3080  hypothetical protein  24.47 
 
 
422 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171333  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2018  hypothetical protein  27.9 
 
 
436 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.571015  normal  0.258757 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0070  hypothetical protein  29.71 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0347  secreted protein  27.98 
 
 
326 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1222  von Willebrand factor, type A  28.04 
 
 
888 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4275  putative lipoprotein  28.85 
 
 
460 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.411161  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6715  hypothetical protein  27.62 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.91 
 
 
1547 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  30.29 
 
 
759 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4117  IgA peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M64  29.32 
 
 
478 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4248  IgA peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M64  29.79 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4271  IgA peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M64  29.26 
 
 
459 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.424525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  31.36 
 
 
1488 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  37.86 
 
 
5544 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  27.39 
 
 
808 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  26.78 
 
 
742 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  30.23 
 
 
3793 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1638  hypothetical protein  26.2 
 
 
455 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1632  hypothetical protein  26.2 
 
 
455 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.78 
 
 
991 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 
1343 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  33.96 
 
 
1602 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.17 
 
 
3324 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  34.04 
 
 
711 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  34.48 
 
 
1620 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  26.39 
 
 
627 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>