21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2872 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2872  Peptidase M64, IgA  100 
 
 
785 aa  1568    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2018  hypothetical protein  41.6 
 
 
436 aa  231  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.571015  normal  0.258757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3080  hypothetical protein  37.24 
 
 
422 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171333  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6715  hypothetical protein  44.13 
 
 
353 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0347  secreted protein  37.58 
 
 
326 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1179  hypothetical protein  26.64 
 
 
603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.952655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  38.19 
 
 
1427 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  35.96 
 
 
1422 aa  101  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  43.05 
 
 
1426 aa  98.2  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  39.61 
 
 
1019 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0070  hypothetical protein  29.66 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.67 
 
 
940 aa  82  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1222  von Willebrand factor, type A  37.13 
 
 
888 aa  77  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4275  putative lipoprotein  31.11 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.411161  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3935  IgA peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M64  28.9 
 
 
510 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819698  normal  0.416212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4117  IgA peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M64  32.57 
 
 
478 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4248  IgA peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M64  32.02 
 
 
459 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4271  IgA peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M64  32.02 
 
 
459 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.424525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.26 
 
 
1246 aa  52  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3309  hypothetical protein  29.87 
 
 
188 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109766  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0229  hypothetical protein  26.29 
 
 
187 aa  45.8  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.318648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>