43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0193 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0193  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  32.9 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  32.17 
 
 
1168 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  30.7 
 
 
1150 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  32.14 
 
 
1989 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  26.11 
 
 
3921 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  29.27 
 
 
2573 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.22 
 
 
3191 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  30.39 
 
 
983 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  30.71 
 
 
1293 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  31.47 
 
 
3602 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  29.51 
 
 
909 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1728  hypothetical protein  34.46 
 
 
639 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633344  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  30.77 
 
 
3911 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  27.38 
 
 
599 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  35.48 
 
 
5544 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  33.14 
 
 
2553 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  26.25 
 
 
3471 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  25.69 
 
 
2121 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5065  hypothetical protein  35.14 
 
 
301 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.201013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  25.69 
 
 
2520 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  35.14 
 
 
726 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  27.88 
 
 
2000 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1002  hypothetical protein  32.64 
 
 
718 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  26.62 
 
 
587 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 
1857 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  31.97 
 
 
826 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  29.55 
 
 
4896 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  31.52 
 
 
1580 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  27.44 
 
 
1537 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  25.52 
 
 
2520 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  32.63 
 
 
487 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  27.24 
 
 
2853 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  26.87 
 
 
3634 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  24.79 
 
 
571 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  24.08 
 
 
951 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  24.36 
 
 
3471 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  24.18 
 
 
3521 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  24.36 
 
 
2025 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  33.58 
 
 
898 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  25.13 
 
 
1227 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  28.43 
 
 
1202 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  35.92 
 
 
4013 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>