34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1282 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1282  Cna B domain-containing protein  100 
 
 
248 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.204415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  37.38 
 
 
3373 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  35.16 
 
 
2656 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6957  hypothetical protein  44.64 
 
 
372 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  29.09 
 
 
1337 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  29.09 
 
 
1337 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  32.2 
 
 
440 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  36.28 
 
 
2604 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
436 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  28.57 
 
 
436 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  40.54 
 
 
2047 aa  52  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  43.06 
 
 
1263 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  39.33 
 
 
5166 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.72 
 
 
753 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  27.34 
 
 
5517 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  35.53 
 
 
1809 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.9 
 
 
1336 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  29.46 
 
 
733 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  40 
 
 
3324 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  42.03 
 
 
5203 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  24 
 
 
892 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  27.75 
 
 
2990 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  28.69 
 
 
130 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.24 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  36.11 
 
 
965 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 
1153 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 
1153 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  36.11 
 
 
965 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  27.27 
 
 
1243 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  29.35 
 
 
1519 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  42.11 
 
 
1984 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  36.25 
 
 
1727 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3593  hypothetical protein  35.11 
 
 
695 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  33.85 
 
 
1537 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>