16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3593 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3593  hypothetical protein  100 
 
 
695 aa  1350    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1979  hypothetical protein  25.17 
 
 
783 aa  77  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  36.56 
 
 
689 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  39.13 
 
 
2990 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  37.78 
 
 
924 aa  48.5  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  32.99 
 
 
898 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  32.43 
 
 
5544 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  40 
 
 
130 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  40 
 
 
1727 aa  46.6  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  35.82 
 
 
3373 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  36.99 
 
 
1531 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  32.93 
 
 
2000 aa  45.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  31.51 
 
 
1984 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  43.75 
 
 
1243 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  28.77 
 
 
1337 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  28.77 
 
 
1337 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>