16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6957 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6957  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.6 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6956  hypothetical protein  40.49 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0131  hypothetical protein  38.27 
 
 		 266 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0130  hypothetical protein  34.17 
 
 		 265 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0129  hypothetical protein  33.61 
 
 		 267 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1282  Cna B domain-containing protein  44.64 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.204415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  33.63 
 
 		 2604 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  37.36 
 
 		 5166 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  32.47 
 
 		 2656 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  36.67 
 
 		 3373 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  37.5 
 
 		 5203 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  37.33 
 
 		 1337 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  37.33 
 
 		 1337 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  33.85 
 
 		 2047 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  37.8 
 
 		 1243 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>