38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24340  putative collagen-binding protein  100 
 
 		 845 aa  1726    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  26.92 
 
 		 863 aa  77  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00820  putative collagen-binding protein  32.74 
 
 		 764 aa  72.8  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0774638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.28 
 
 		 1328 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  27.79 
 
 		 1307 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  24.87 
 
 		 729 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  26.45 
 
 		 1508 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  25.52 
 
 		 1804 aa  65.1  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.54 
 
 		 971 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  43.97 
 
 		 2281 aa  62  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0375  hypothetical protein  35.16 
 
 		 2320 aa  62  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  26.26 
 
 		 969 aa  61.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  26.26 
 
 		 969 aa  61.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  30 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.7 
 
 		 1112 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  34.01 
 
 		 745 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00100  putative cell wall binding protein  39.08 
 
 		 172 aa  58.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.44 
 
 		 3210 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0909  Cna B domain protein  34.31 
 
 		 1888 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.67463  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  34.06 
 
 		 913 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  23.85 
 
 		 731 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  25.23 
 
 		 3333 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.23 
 
 		 3486 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  25.79 
 
 		 882 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  26.55 
 
 		 2179 aa  52  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  26.28 
 
 		 3393 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  25.88 
 
 		 3242 aa  52  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  26.54 
 
 		 1102 aa  51.6  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  26.28 
 
 		 3392 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  34.19 
 
 		 539 aa  50.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  25.15 
 
 		 2272 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25 
 
 		 3190 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  33.55 
 
 		 4909 aa  47.8  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  25.07 
 
 		 2136 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05650  fibro-slime domain-containing protein  28.03 
 
 		 1104 aa  47.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  28.07 
 
 		 920 aa  46.6  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  23.89 
 
 		 853 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  22.41 
 
 		 563 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>