19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1263 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  100 
 
 		 863 aa  1764    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00820  putative collagen-binding protein  50 
 
 		 764 aa  248  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0774638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1637  von Willebrand factor (vWF) domain containing protein  27.79 
 
 		 794 aa  153  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  28.65 
 
 		 2281 aa  140  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24340  putative collagen-binding protein  26.92 
 
 		 845 aa  78.2  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0375  hypothetical protein  35.35 
 
 		 2320 aa  76.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00100  putative cell wall binding protein  38.18 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05650  fibro-slime domain-containing protein  30.85 
 
 		 1104 aa  58.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  32.82 
 
 		 540 aa  51.2  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  27.81 
 
 		 920 aa  50.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.78 
 
 		 3190 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  23.54 
 
 		 1307 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0122  Cna B domain-containing protein  32.05 
 
 		 1429 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  33.07 
 
 		 480 aa  48.5  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.38 
 
 		 1328 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  29.71 
 
 		 539 aa  46.2  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  31.18 
 
 		 482 aa  45.4  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  30.82 
 
 		 549 aa  45.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  25.28 
 
 		 928 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>