38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36729 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_36729  Signal sequence processing protein  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.501968  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10354  Signal peptidase I (AFU_orthologue; AFUA_3G12840)  49.45 
 
 
192 aa  192  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0778272  normal  0.862016 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51280  predicted protein  51.5 
 
 
185 aa  159  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87247  predicted protein  49.37 
 
 
203 aa  145  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0943769  normal  0.664844 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00480  conserved hypothetical protein  55.15 
 
 
221 aa  128  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  32.62 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  31.91 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1306  signal peptidase I  29.71 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.822396  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0208  peptidase S26B, signal peptidase  32.85 
 
 
236 aa  57.4  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  29.51 
 
 
353 aa  55.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  34.26 
 
 
420 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1734  peptidase S26B, signal peptidase  26.06 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  29.73 
 
 
216 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1374  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  25.16 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  33.07 
 
 
189 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  33.07 
 
 
189 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  30.97 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  35.71 
 
 
368 aa  46.6  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  30.97 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  30.97 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  30.97 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  30.97 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  30.97 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  30.97 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  30.97 
 
 
189 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  31.71 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  32.62 
 
 
197 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1004  signal sequence peptidase  27.86 
 
 
185 aa  44.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  42.5 
 
 
179 aa  44.3  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0503  peptidase S26B, signal peptidase  30.77 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  30.36 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0232  peptidase S26B, signal peptidase  35 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.197402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2836  peptidase S26B, signal peptidase  30.3 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0816  signal sequence peptidase  23.81 
 
 
215 aa  41.2  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.019446  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  25.74 
 
 
179 aa  40.8  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2961  signal peptidase SipW  27.07 
 
 
270 aa  40.8  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2206  peptidase S26B, signal peptidase  34.25 
 
 
309 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>