31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2206 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2206  peptidase S26B, signal peptidase  100 
 
 
309 aa  580  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  32.06 
 
 
166 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  27.06 
 
 
217 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  31.3 
 
 
166 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  40 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  36.92 
 
 
420 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  25.45 
 
 
174 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  40.86 
 
 
368 aa  52.4  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  36.19 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3518  peptidase S26B, signal peptidase  30.91 
 
 
185 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00808654  normal  0.222242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3635  peptidase S26B, signal peptidase  30.39 
 
 
191 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  28.32 
 
 
189 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  27.59 
 
 
189 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  27.59 
 
 
189 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  27.59 
 
 
189 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  27.59 
 
 
189 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  27.59 
 
 
189 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  26.72 
 
 
189 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  26.72 
 
 
189 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  37.5 
 
 
166 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2922  peptidase S26B, signal peptidase  32.32 
 
 
218 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  26.96 
 
 
189 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  26.96 
 
 
191 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1239  peptidase S24, S26A and S26B  29.2 
 
 
203 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0208  peptidase S26B, signal peptidase  32.98 
 
 
236 aa  46.2  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  34.09 
 
 
222 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  32.47 
 
 
189 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34110  Peptidase S24-like protein  39.24 
 
 
192 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17050  signal peptidase I  30.82 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0856146  normal  0.95048 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 
197 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  35.06 
 
 
185 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>