53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0480 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  100 
 
 		 166 aa  323  9e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  95.78 
 
 		 174 aa  313  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  40.88 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  39.19 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  38.38 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  41.24 
 
 		 368 aa  79  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  39.39 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  33.57 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  35.71 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  31.65 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  45.26 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  30.77 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  30.77 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  31.47 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  31.47 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  30.77 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  30.77 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  30.77 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  34.62 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  34.62 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  33.87 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  35.87 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  30.88 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2961  signal peptidase SipW  32.06 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  33.68 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0890  peptidase S26B, signal peptidase  28.57 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2922  peptidase S26B, signal peptidase  33.94 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  33.67 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0503  peptidase S26B, signal peptidase  28.95 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0663  peptidase S26B, signal peptidase  26.89 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0959  peptidase S26B, signal peptidase  23.73 
 
 		 217 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.338093  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0869  peptidase S26B, signal peptidase  31.25 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  29.23 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3518  peptidase S26B, signal peptidase  31.15 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00808654  normal  0.222242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3635  peptidase S26B, signal peptidase  23.74 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2822  peptidase S26B, signal peptidase  30.77 
 
 		 351 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2206  peptidase S26B, signal peptidase  37.5 
 
 		 309 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0208  peptidase S26B, signal peptidase  31.25 
 
 		 236 aa  47.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  36.63 
 
 		 618 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1251  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  24.85 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3743  peptidase S26B, signal peptidase  27.94 
 
 		 385 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1382  peptidase S26B, signal peptidase  33.61 
 
 		 381 aa  44.7  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1385  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  25.44 
 
 		 213 aa  44.7  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.448996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  29.13 
 
 		 448 aa  44.3  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3849  hypothetical protein  32.99 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0523  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  24.26 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  28.42 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17050  signal peptidase I  26.83 
 
 		 232 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0856146  normal  0.95048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1374  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  34.18 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359092  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0980  peptidase S26B, signal peptidase  25.58 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.27603 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0480  peptidase S26B, signal peptidase  25 
 
 		 387 aa  40.8  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.466927  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  24.62 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3509  peptidase S26B, signal peptidase  29.82 
 
 		 391 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>