15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1251 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1251  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0523  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  95.81 
 
 
191 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1385  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  86.91 
 
 
213 aa  352  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.448996  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1374  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  66.67 
 
 
184 aa  248  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359092  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1306  signal peptidase I  48.66 
 
 
167 aa  143  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.822396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  25 
 
 
174 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  24.85 
 
 
166 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 
179 aa  44.7  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  23.2 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  30.11 
 
 
166 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  35.94 
 
 
368 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3375  peptidase S26B, signal peptidase  26.29 
 
 
397 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  23.24 
 
 
185 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  25 
 
 
217 aa  42  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1382  peptidase S26B, signal peptidase  31.62 
 
 
381 aa  41.2  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.287318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>