More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47370 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  100 
 
 		 179 aa  360  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  97.21 
 
 		 187 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  40 
 
 		 272 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  39.11 
 
 		 266 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  39.11 
 
 		 267 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  38.92 
 
 		 226 aa  126  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  42.62 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  42.62 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  41.62 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  40.33 
 
 		 262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  41.62 
 
 		 284 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  39.56 
 
 		 274 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  38.89 
 
 		 297 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  41.32 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  37.09 
 
 		 305 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  40.74 
 
 		 284 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  40.74 
 
 		 284 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  39.09 
 
 		 297 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  39.2 
 
 		 270 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  40 
 
 		 284 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  39.46 
 
 		 284 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  39.39 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  40.22 
 
 		 283 aa  121  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  41.72 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  40 
 
 		 284 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  40 
 
 		 284 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  38.92 
 
 		 284 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  37 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  40.67 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  40.67 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  37.84 
 
 		 284 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  44.6 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  38.35 
 
 		 262 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  36.87 
 
 		 321 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  36.59 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  36.98 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  37.5 
 
 		 324 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  36.69 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  37.69 
 
 		 322 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  37.69 
 
 		 322 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  37.37 
 
 		 297 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  40 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  39.55 
 
 		 288 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  35.06 
 
 		 322 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  35.15 
 
 		 325 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  35.71 
 
 		 288 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  33.9 
 
 		 255 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  35.82 
 
 		 322 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  36.61 
 
 		 267 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  37.56 
 
 		 321 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  37.19 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  36.96 
 
 		 260 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  37.19 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  37.19 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  37.19 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  37.19 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  36.96 
 
 		 260 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  37.19 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  38.3 
 
 		 342 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  37 
 
 		 325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  37.19 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  33.14 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  32.97 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  35.6 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  32.99 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  41.84 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  38 
 
 		 190 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  38.71 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  40 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  35 
 
 		 325 aa  111  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  36.41 
 
 		 260 aa  111  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  40.27 
 
 		 214 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  34.45 
 
 		 299 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  38.2 
 
 		 187 aa  110  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  41.57 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.47 
 
 		 190 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  37.63 
 
 		 247 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  41.67 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  40.13 
 
 		 373 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  41.33 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  34.9 
 
 		 298 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  36.27 
 
 		 299 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  37.06 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.85 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  37.88 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  37.58 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  38.04 
 
 		 247 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  34.54 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  33.67 
 
 		 299 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  33.49 
 
 		 299 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  38.04 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  35.71 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  34.62 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>