More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0412 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  100 
 
 		 268 aa  550  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  90.67 
 
 		 268 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  60.47 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  60.8 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  61.26 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  58.58 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  60.26 
 
 		 299 aa  352  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  62.17 
 
 		 262 aa  333  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  56.48 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  55.81 
 
 		 297 aa  329  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  55.81 
 
 		 297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  55.81 
 
 		 297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  55.81 
 
 		 297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  56.15 
 
 		 297 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  56.15 
 
 		 297 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  56.67 
 
 		 297 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  54.85 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  56.33 
 
 		 297 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  56.33 
 
 		 297 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  56.33 
 
 		 297 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  56.33 
 
 		 297 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  56.33 
 
 		 297 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  56.33 
 
 		 297 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  56.33 
 
 		 297 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  54.7 
 
 		 321 aa  318  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  55.67 
 
 		 297 aa  314  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  54.52 
 
 		 321 aa  313  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  55.33 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  52.84 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  53 
 
 		 322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  52.67 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  54.49 
 
 		 297 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  53 
 
 		 322 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  54.18 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  53 
 
 		 322 aa  301  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  52.67 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  50 
 
 		 342 aa  298  9e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  57.46 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  52.96 
 
 		 269 aa  275  6e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  55.69 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  51.12 
 
 		 248 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  51.12 
 
 		 248 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  45.93 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  44.91 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  45.68 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  48.08 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  43.97 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  46.86 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  44.44 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  45.15 
 
 		 266 aa  224  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  45.64 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  45.64 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  45.64 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  46.86 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  46.2 
 
 		 284 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  46.2 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  47.74 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  46.53 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  46.54 
 
 		 262 aa  222  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  44.67 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  44.67 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  44.67 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  44.67 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  43.97 
 
 		 304 aa  221  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  43.23 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  43.37 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  43.37 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  43.37 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  43.23 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  43.23 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  43.23 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  43.23 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  44.56 
 
 		 304 aa  218  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  41.04 
 
 		 325 aa  218  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  45.61 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  43.64 
 
 		 305 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  42.91 
 
 		 300 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  44.88 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  43.86 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  44.17 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  43.96 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  42.12 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  43.97 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  44.08 
 
 		 284 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  43.75 
 
 		 284 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  45.14 
 
 		 251 aa  215  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  44.74 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  45.42 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  42.09 
 
 		 322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  42.44 
 
 		 324 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  43.94 
 
 		 305 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  42.77 
 
 		 324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  42.77 
 
 		 324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  42.77 
 
 		 324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  42.77 
 
 		 324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  42.55 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  42.51 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  43.16 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  41.42 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  40.5 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>