More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0282 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  70.1 
 
 		 199 aa  288  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  69.79 
 
 		 198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  61.03 
 
 		 200 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  61.98 
 
 		 199 aa  255  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  56.22 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  57.61 
 
 		 221 aa  217  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  52.22 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  55.91 
 
 		 225 aa  208  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  53.2 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  51.2 
 
 		 221 aa  207  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  53.2 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  50 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  53.27 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  53.57 
 
 		 222 aa  194  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  54.82 
 
 		 226 aa  191  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  55.96 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  46.12 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  42.67 
 
 		 288 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  40.09 
 
 		 255 aa  171  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  41.78 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  41.78 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  40.76 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  41.04 
 
 		 251 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  41.04 
 
 		 251 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  41.7 
 
 		 270 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  38.05 
 
 		 262 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  38.7 
 
 		 299 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  39.04 
 
 		 297 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  39.13 
 
 		 299 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  39.04 
 
 		 297 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  49.44 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  39.55 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  38.5 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  42.51 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  39.04 
 
 		 297 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  39.04 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.6 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  39.04 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  39.04 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  40.35 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  46.89 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  39.5 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  38.22 
 
 		 267 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  37.55 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  37.55 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  38.53 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  41.51 
 
 		 284 aa  154  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  36.33 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  33.96 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  42.08 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  39.37 
 
 		 324 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  40.09 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  33.59 
 
 		 289 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  40.28 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  40.85 
 
 		 284 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  40.57 
 
 		 284 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  38.46 
 
 		 342 aa  151  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  40.85 
 
 		 284 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  39.91 
 
 		 284 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  41.31 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  38.05 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  39.81 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  41.97 
 
 		 274 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  34.32 
 
 		 275 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  40.85 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  35.81 
 
 		 297 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  36.24 
 
 		 297 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  41.04 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  35.52 
 
 		 268 aa  148  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  34.75 
 
 		 279 aa  148  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  38.74 
 
 		 322 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  37.1 
 
 		 325 aa  147  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  38.81 
 
 		 325 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  37.22 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  34.22 
 
 		 276 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  41.71 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  36.2 
 
 		 322 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  36.2 
 
 		 322 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  33.58 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  36.73 
 
 		 322 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  41.62 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  37.5 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  35.83 
 
 		 305 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  35.93 
 
 		 325 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  36.09 
 
 		 321 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  40.51 
 
 		 247 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  39.47 
 
 		 297 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  40.51 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  39.04 
 
 		 297 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  38.28 
 
 		 324 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  42.7 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  35.16 
 
 		 321 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  36.73 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  39.04 
 
 		 297 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  38.6 
 
 		 297 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  36.03 
 
 		 321 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  36.16 
 
 		 305 aa  141  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  42.47 
 
 		 184 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  35.11 
 
 		 321 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>