More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1676 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  73.91 
 
 		 276 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  73.19 
 
 		 276 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  70.29 
 
 		 289 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  69.57 
 
 		 275 aa  417  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  67.91 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  64.71 
 
 		 279 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  30.81 
 
 		 398 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  30.08 
 
 		 517 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  34.05 
 
 		 372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  31.87 
 
 		 498 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.73 
 
 		 199 aa  165  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.47 
 
 		 225 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.98 
 
 		 198 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  35.06 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  29.62 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  38.56 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.85 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  32.81 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  33.58 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.22 
 
 		 199 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  34.68 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.33 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35.1 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35.1 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.33 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  36.36 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  34.54 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  32.73 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  33.6 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  33.58 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  33.58 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  26.92 
 
 		 530 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  29.71 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  34.66 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  34.66 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  34.66 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  34.66 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  35.98 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  30.88 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  36.24 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  32.25 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  34.6 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  33.96 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  36.24 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  36.24 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  33.57 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  33.57 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  33.57 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  36.24 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  32.94 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  31.06 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  35.81 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  35.81 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  35.37 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  32.83 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  32.43 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  29.35 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  34.62 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  33.33 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  32.45 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  32.82 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  32.92 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  33.57 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  31.07 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  32.82 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  30.8 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  36.14 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  32.5 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  32.86 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  30.43 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  30.6 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  32.43 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  32.78 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.93 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  36.52 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  32.57 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  32.74 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  33.59 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  32.78 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  33.75 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  31.69 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  31.58 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  32.81 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  31.71 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  32.26 
 
 		 380 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  31.23 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  31.2 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  32.21 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  35.15 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  34.14 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  33.21 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  33.58 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  35.18 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  33.76 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  33.1 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  33.21 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  33.21 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  30.56 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  32 
 
 		 221 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>