More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6436 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  100 
 
 		 393 aa  818    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  52.13 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  41.22 
 
 		 465 aa  306  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  43.92 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  43.11 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  40.9 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  41.19 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  42.56 
 
 		 517 aa  276  6e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  39.4 
 
 		 530 aa  270  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  41.19 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  38.99 
 
 		 498 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  38.69 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  38.19 
 
 		 364 aa  252  7e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  35.58 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  31.79 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  30.39 
 
 		 289 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  30.69 
 
 		 276 aa  172  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  30.36 
 
 		 276 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  29.62 
 
 		 276 aa  169  9e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  30.1 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  38.97 
 
 		 302 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  33.51 
 
 		 275 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  26.43 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  24.33 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  26.35 
 
 		 305 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  26.11 
 
 		 305 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  24.14 
 
 		 300 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.25 
 
 		 219 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  30.22 
 
 		 225 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  30.65 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  32.61 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  32 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  31.55 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  31.43 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  30.86 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  23.71 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  30.17 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  27.51 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  28.95 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  31.02 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  29.83 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  25.65 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  28.79 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  26.7 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  27.37 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  30.29 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  27.81 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  23.24 
 
 		 240 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  25.81 
 
 		 262 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  25.81 
 
 		 279 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  28.43 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  70 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0326  signal peptidase I  24.87 
 
 		 321 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  55.36 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  70 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  55.36 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  23.86 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  23.86 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  55.36 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  70 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  27.96 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  43.18 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  30.23 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  43.18 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  23.86 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  27.62 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  50.79 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  51.67 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  27.93 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  25.89 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  60.87 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  24.73 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  67.5 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  32.57 
 
 		 252 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  25.68 
 
 		 262 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  67.5 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  24.79 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  28.12 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  41.11 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  70 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  26.34 
 
 		 278 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  61.7 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  28.07 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  38.32 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  26.79 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  26.79 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  57.69 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  67.5 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  56 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  68.42 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  64.44 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  28.69 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  27.23 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  64.44 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  59.57 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  68.42 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  26.52 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  28.98 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  56 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  55.36 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>