More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1568 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  100 
 
 		 289 aa  600  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  70.55 
 
 		 275 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  70.29 
 
 		 276 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  67.39 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  66.3 
 
 		 276 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  63.14 
 
 		 279 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  62.55 
 
 		 268 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  37.07 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  30.18 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  31.74 
 
 		 364 aa  175  7e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  30.39 
 
 		 393 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  30.23 
 
 		 398 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  28.45 
 
 		 517 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  29.4 
 
 		 392 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.59 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  30.45 
 
 		 498 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  38.34 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  35.37 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  32.37 
 
 		 219 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.97 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  33.47 
 
 		 225 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  33.21 
 
 		 199 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  32.64 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  33.33 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  34.71 
 
 		 222 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  35.1 
 
 		 255 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  35.89 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  30.91 
 
 		 219 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  32.7 
 
 		 200 aa  146  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  34.68 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  34.68 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  34.68 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  33.2 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  30.8 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  34.68 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  31.93 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  32.12 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  31.93 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.4 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.4 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.4 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.4 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  36.09 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  36.09 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  34.48 
 
 		 325 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  36.09 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  33.33 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  35.9 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.71 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  35.15 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  36.12 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  35.17 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  30.26 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  33.97 
 
 		 206 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  36.96 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  33.86 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.32 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.47 
 
 		 214 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  35.19 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  35.19 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  35.19 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  35.19 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  35.19 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  35.19 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  35.19 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  35.19 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  32.07 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  32.58 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  30.69 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  30.71 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.5 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  32.5 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  34.27 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  33.33 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  34.33 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  31.09 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  33.33 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  33.33 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.32 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  34.62 
 
 		 325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  34.5 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  32.76 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  32.09 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  34.05 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  31.48 
 
 		 221 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  33.2 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  34.76 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  34.36 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  33.61 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  34.19 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  32.17 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  33.6 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  32.41 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  32.94 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  33.72 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>