More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0206 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  100 
 
 		 517 aa  1058    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  54.95 
 
 		 530 aa  586  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  49.32 
 
 		 517 aa  488  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  43.72 
 
 		 398 aa  316  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  42.47 
 
 		 378 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  41.6 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  44.09 
 
 		 393 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  40.36 
 
 		 498 aa  273  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  39.11 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  40.37 
 
 		 389 aa  266  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  39.02 
 
 		 390 aa  260  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  37.66 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  39.27 
 
 		 372 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  34.78 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  30.08 
 
 		 276 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  28.82 
 
 		 279 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  28.45 
 
 		 289 aa  169  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  28.42 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  32.94 
 
 		 302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  27.49 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  38.89 
 
 		 276 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  35.61 
 
 		 268 aa  104  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  40.71 
 
 		 276 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  25.35 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  25.77 
 
 		 322 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  25.26 
 
 		 332 aa  97.4  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  26.24 
 
 		 299 aa  96.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  25 
 
 		 332 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  25 
 
 		 321 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  24.63 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  25 
 
 		 332 aa  95.5  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  24.66 
 
 		 324 aa  95.1  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  24.25 
 
 		 268 aa  94.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  26.47 
 
 		 325 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  24.16 
 
 		 322 aa  92.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  25 
 
 		 322 aa  89  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0782  signal peptidase I  24.25 
 
 		 349 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  25.07 
 
 		 322 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  22.8 
 
 		 300 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  27.43 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  22.8 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  24.62 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  26.86 
 
 		 306 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  29.13 
 
 		 253 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  33.33 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  30.77 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  30.43 
 
 		 252 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  22.34 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  30.2 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  27.49 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  29.81 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  27.89 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  29.68 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  29.56 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  28.67 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  23.44 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  31.93 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  30.32 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4225  hypothetical protein  40.79 
 
 		 139 aa  77.4  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  28 
 
 		 247 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  28 
 
 		 247 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  30.36 
 
 		 275 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  26.06 
 
 		 219 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  46.24 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  28.22 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  29.27 
 
 		 214 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  46.24 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  30.26 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  26.19 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  27.71 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  26.19 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  29.41 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  27.75 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  25 
 
 		 216 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  32.47 
 
 		 271 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  27.81 
 
 		 340 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  28.93 
 
 		 247 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  27.52 
 
 		 225 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  30.72 
 
 		 260 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  32.24 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  29.9 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  31.13 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  32.24 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  27.81 
 
 		 220 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  26.85 
 
 		 225 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0230  hypothetical protein  32.2 
 
 		 161 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  32.24 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  33.11 
 
 		 255 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  30.72 
 
 		 260 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  28.09 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  24.71 
 
 		 221 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  27.92 
 
 		 263 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  29.61 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  30.36 
 
 		 282 aa  72  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  31.1 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  52.46 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  27.74 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  27.78 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  43.68 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  43.68 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>