More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2650 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  97.62 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  92.86 
 
 		 252 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  89.29 
 
 		 252 aa  482  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  88.89 
 
 		 252 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  94.84 
 
 		 252 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  87.35 
 
 		 253 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  72.22 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  64.49 
 
 		 268 aa  322  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  64.49 
 
 		 268 aa  322  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  64.49 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  59.51 
 
 		 259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  63.05 
 
 		 271 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  64.32 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  60.87 
 
 		 260 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  60.87 
 
 		 260 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  60.47 
 
 		 268 aa  311  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  63.11 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  60.16 
 
 		 260 aa  307  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  60.8 
 
 		 249 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  58.63 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  58.68 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  54.69 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  54.96 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  53.91 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  54.96 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  53.72 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  52 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  49.82 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  50 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  52.84 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  48.88 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  51.09 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  45.83 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  48.79 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  46.67 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  51.61 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  46.64 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  48.24 
 
 		 263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  50.22 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  45.04 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  47.41 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  42.29 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  44.03 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  46.67 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  43.28 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  45.05 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  46.57 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  43.67 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  43.28 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  45.95 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  40.64 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  39.18 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  42.79 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  38.56 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  42.37 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  38.7 
 
 		 305 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  40.99 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  42.08 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  38.81 
 
 		 305 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  42.79 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  41.05 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  42.13 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  42.13 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  41.83 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  43.9 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  43.9 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  41.51 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  39.37 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  39.83 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  37.04 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  39.83 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  41.55 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  43.84 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  36.1 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  41.13 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  40.28 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  37.39 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  37.17 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  39.91 
 
 		 297 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  39.64 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  37.64 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  42.08 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  37.14 
 
 		 298 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.89 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  36.92 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  34.95 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  35.79 
 
 		 305 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  39.35 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>