More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1150 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  97.57 
 
 
247 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  83.81 
 
 
247 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  78.46 
 
 
247 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  59.51 
 
 
249 aa  313  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  62.1 
 
 
260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  60.57 
 
 
260 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  60.57 
 
 
260 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  55.27 
 
 
260 aa  269  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  55.65 
 
 
253 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  55.37 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  54.96 
 
 
252 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  55.88 
 
 
252 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  53.6 
 
 
259 aa  267  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  52.17 
 
 
268 aa  266  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  53.72 
 
 
252 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  54.51 
 
 
250 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  54.13 
 
 
252 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  50.97 
 
 
263 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  53.57 
 
 
263 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  52.42 
 
 
245 aa  252  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  52.78 
 
 
263 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  56.33 
 
 
252 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  52.28 
 
 
268 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  52.28 
 
 
268 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  52.28 
 
 
268 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  53.66 
 
 
271 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  50.19 
 
 
279 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  50.19 
 
 
262 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  50.19 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  47.98 
 
 
270 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  48.33 
 
 
262 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  46.25 
 
 
252 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  45.8 
 
 
282 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  47.58 
 
 
263 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  50.67 
 
 
286 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  49.12 
 
 
236 aa  215  5e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  48.69 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  45.83 
 
 
255 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  43.49 
 
 
293 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  43.72 
 
 
287 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  47.91 
 
 
235 aa  196  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  46.93 
 
 
252 aa  194  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  47.58 
 
 
248 aa  192  4e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  42.11 
 
 
278 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  43.81 
 
 
264 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  43.22 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  48.83 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  45.89 
 
 
317 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  40.57 
 
 
255 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  45.05 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  42.86 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  41.6 
 
 
305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  45.71 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  39.05 
 
 
305 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  41.57 
 
 
305 aa  161  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  41.09 
 
 
305 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  41.09 
 
 
305 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  41.09 
 
 
305 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  41.09 
 
 
305 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  47.5 
 
 
267 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  42.92 
 
 
325 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  40.48 
 
 
305 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  40.48 
 
 
305 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  39.02 
 
 
255 aa  158  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  40.48 
 
 
305 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  44.7 
 
 
325 aa  158  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  39.42 
 
 
270 aa  158  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  41.49 
 
 
199 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  36.72 
 
 
256 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  38.34 
 
 
298 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  38.81 
 
 
305 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  40.62 
 
 
305 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  46.46 
 
 
266 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  42.48 
 
 
256 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  38.49 
 
 
278 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  43.84 
 
 
322 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  40.32 
 
 
305 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  43.84 
 
 
322 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  40.47 
 
 
290 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  42.53 
 
 
267 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  42.66 
 
 
324 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  39.2 
 
 
301 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  37.23 
 
 
325 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  35.54 
 
 
321 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  39.23 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  39 
 
 
299 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  41.27 
 
 
304 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  41.25 
 
 
198 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  39.84 
 
 
240 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  40.74 
 
 
251 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  40 
 
 
300 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  34.84 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  42.08 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  36.88 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  39.44 
 
 
304 aa  152  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  38.29 
 
 
322 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  44.04 
 
 
325 aa  151  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  36.17 
 
 
324 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  39.22 
 
 
245 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>