More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0992 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  100 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  78.65 
 
 		 268 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  64.2 
 
 		 263 aa  329  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  62.03 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  63.1 
 
 		 268 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  63.1 
 
 		 250 aa  315  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  61.51 
 
 		 268 aa  315  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  61.51 
 
 		 268 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  60.9 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  61.45 
 
 		 252 aa  309  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  60.39 
 
 		 252 aa  308  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  60.8 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  59.44 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  58.63 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  58.87 
 
 		 252 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  59.44 
 
 		 252 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  58.23 
 
 		 249 aa  288  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  55.95 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  56.45 
 
 		 260 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  56.45 
 
 		 260 aa  285  8e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  52.8 
 
 		 259 aa  278  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  55.65 
 
 		 245 aa  272  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  50.79 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  52.02 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  50.97 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  50.97 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  52.05 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  49.8 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  50 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  50.78 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  49.62 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  48.87 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  48.87 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  52.09 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  49.81 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  46.54 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  47.41 
 
 		 248 aa  208  9e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  45.04 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  45.45 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  47.5 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  45.87 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  48.2 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  42.37 
 
 		 293 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  48.53 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  42.44 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  46.51 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  47.69 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  42.98 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  44.59 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  42.13 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  43.56 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  44.64 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  44.59 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  39.78 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  39.69 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.36 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  41.78 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  38.46 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  39.59 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  39.59 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  41.63 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  39.68 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  40.09 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  40.09 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  37.91 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  41.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  40.85 
 
 		 305 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  40.91 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  43.14 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  41.82 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  40 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  40 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  40 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  37.55 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  38.93 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  39.01 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  39.56 
 
 		 299 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  37.22 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  37.22 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  37.22 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  40.18 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  40.18 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  39.08 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  44.76 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  38.84 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  38.52 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  40.48 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.92 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  44.76 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  44.29 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  37.64 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  37.64 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  37.64 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  37.01 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  37.64 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  38.18 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  40.36 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  36.96 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.19 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  39.91 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>