More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1410 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 		 278 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  57.63 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  52.43 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  47.3 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  45.04 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  41.27 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  41.7 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  41.7 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  41.04 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  40.67 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  41.06 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  41.92 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  41.83 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  38.81 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  38.2 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  39.18 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  41.48 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  40.74 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  39.41 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  39.78 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  37.55 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  39.84 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  39.18 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  39.93 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  37.45 
 
 		 247 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  39.85 
 
 		 247 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  38.02 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  39.41 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  38.4 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  38.97 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  38.97 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  38.49 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  38 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  37.25 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  37.59 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  40.15 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  37.5 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  38.6 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  39.03 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  38.63 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  36.96 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  36.33 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  37.89 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  38.55 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  35.9 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  34.92 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  33.96 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  35.56 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  34.69 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  34.26 
 
 		 245 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  33.47 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  39.62 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  34.48 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  35.9 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  35.74 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  35.74 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  32.06 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  33.48 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  32.38 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.48 
 
 		 266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  34.73 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.44 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  36.44 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  31.45 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  32.9 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  29.92 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  37.5 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  34.73 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  32.57 
 
 		 332 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  33.47 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.47 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.47 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.47 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  33.06 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  33.47 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  32.18 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  34.65 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  33.06 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  32.69 
 
 		 305 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  34.38 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35.81 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35.81 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  33.89 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  32.93 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  31.98 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.06 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  34.2 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  31.88 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  34.81 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  32.75 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  34.75 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  32.6 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  32.31 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  35.93 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  31.89 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  31.8 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  32.31 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  33.09 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  32.53 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  32.95 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>