More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0909 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  100 
 
 		 301 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  53.85 
 
 		 290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  52.43 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  46.24 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  43.78 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  40.53 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  37.88 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  38.87 
 
 		 255 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  38.35 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  36.79 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  40.34 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  38.17 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  38.96 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  39.16 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  40.23 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  39.78 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  38.98 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  38.6 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  38.55 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  38.93 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  37.06 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  38.58 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  37.92 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  38.67 
 
 		 249 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  37.4 
 
 		 252 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  37.31 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  37.02 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  37.5 
 
 		 268 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  40.43 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  37.3 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  36.96 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  37.22 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  37.1 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  36.47 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  37.1 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  36.96 
 
 		 262 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  41.26 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  38.71 
 
 		 252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  36.09 
 
 		 252 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  36.74 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  36.74 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  37.02 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  37.8 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  37.11 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  37.34 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  34.43 
 
 		 278 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  34.07 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  37.39 
 
 		 235 aa  123  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  33.11 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  39.38 
 
 		 252 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  35.63 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  36.21 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  35.22 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.12 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.99 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.99 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.99 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  37.25 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  34.12 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  33.99 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  34.12 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  34.38 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4299  signal peptidase I  34.43 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.2 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  33.33 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  33.6 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  33.6 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  37.34 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  33.2 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  33.08 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  35.68 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  32.62 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  35.39 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  33.75 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  32.31 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  32.77 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  32.77 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  33.47 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4311  signal peptidase I  33.05 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  33.19 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4289  signal peptidase I  33.05 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  35.08 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  33.46 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  33.19 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  32.77 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  35.48 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  32.07 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.75 
 
 		 266 aa  99.8  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  33.06 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  36.55 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  34.45 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1615  signal peptidase I  36.25 
 
 		 339 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  32.95 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  33.98 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  34.39 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  34.39 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  34.39 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  34.39 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  34.39 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>