More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1736 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  49.47 
 
 		 255 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  48.68 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  47.67 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  46.21 
 
 		 252 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  46.59 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  46.59 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  45.83 
 
 		 252 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  45.88 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  46.95 
 
 		 247 aa  228  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  46.77 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  45.16 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  46.77 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  45.16 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  43.94 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  45.8 
 
 		 247 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  45.8 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  46.07 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  45.83 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  44.91 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  46.54 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  41.15 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  45.86 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  43.73 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  45.86 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  42.69 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  45.86 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  43.07 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  42.37 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  41.16 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  41.24 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  41.24 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  42.91 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  38.33 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  41.43 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  39.56 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  39.43 
 
 		 252 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  39.38 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  44.54 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  39.64 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  41.41 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  40.7 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  40.16 
 
 		 252 aa  172  7.999999999999999e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  42.92 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  36.96 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  39.39 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  39.83 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  35.79 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  36.96 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  37.4 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  38.06 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  35.51 
 
 		 256 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  37.31 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  34.1 
 
 		 245 aa  139  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  36.36 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  34.17 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.29 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  38.46 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  37.14 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  35.6 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  37.35 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.55 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  36.71 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  37.14 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.93 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  32.62 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  35.66 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  33.33 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  33.33 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  33.93 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  39.7 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  35.15 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  34.41 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  35.42 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  34.68 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  35.8 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  33.69 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  36.4 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  35.92 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  35.92 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  36.67 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  36.67 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  37.76 
 
 		 325 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  36.51 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  34.73 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  39.2 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  32.32 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  33.57 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  35.41 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  35.81 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  33.9 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  35.41 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  32.61 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  33.94 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  35.56 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  34.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  34.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  39.29 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  36.67 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  33.7 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>