More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2027 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  100 
 
 
262 aa  537  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  61.54 
 
 
299 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  59.6 
 
 
297 aa  359  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  59.26 
 
 
297 aa  359  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  68.58 
 
 
262 aa  358  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  60.2 
 
 
299 aa  352  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  56.86 
 
 
305 aa  348  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  57.77 
 
 
297 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  58.11 
 
 
297 aa  341  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  57.77 
 
 
297 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  57.77 
 
 
297 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  57.09 
 
 
297 aa  340  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  57.09 
 
 
297 aa  337  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  57.09 
 
 
297 aa  337  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  57.43 
 
 
322 aa  334  9e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  62.17 
 
 
268 aa  333  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  66.24 
 
 
342 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  62.78 
 
 
269 aa  332  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  56.27 
 
 
325 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  56.8 
 
 
321 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  66.67 
 
 
324 aa  329  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  57.43 
 
 
297 aa  328  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  61.94 
 
 
268 aa  327  9e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  55.25 
 
 
321 aa  325  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  57.43 
 
 
297 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  57.43 
 
 
297 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  57.43 
 
 
297 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  57.43 
 
 
297 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  57.43 
 
 
297 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  57.43 
 
 
297 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  57.43 
 
 
297 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  66.96 
 
 
325 aa  324  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  56.76 
 
 
297 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  56.76 
 
 
297 aa  321  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  54.92 
 
 
325 aa  321  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  64.26 
 
 
322 aa  318  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  61.16 
 
 
322 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  61.57 
 
 
322 aa  316  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  54.21 
 
 
297 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  57.58 
 
 
268 aa  297  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  53.61 
 
 
248 aa  288  6e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  53.61 
 
 
248 aa  288  6e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  48.52 
 
 
270 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  52.45 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  47.62 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  54.69 
 
 
284 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  54.29 
 
 
284 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  46.49 
 
 
262 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  47.81 
 
 
284 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  54.29 
 
 
284 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  54.29 
 
 
284 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  47.39 
 
 
255 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  47.65 
 
 
284 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  46.67 
 
 
284 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  46.67 
 
 
284 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  46.46 
 
 
284 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  53.47 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  46.59 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  46.1 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  47.83 
 
 
263 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  46.32 
 
 
274 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  44.84 
 
 
266 aa  231  9e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  46.27 
 
 
251 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  46.62 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  46.69 
 
 
305 aa  225  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  45.49 
 
 
305 aa  224  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  44.67 
 
 
305 aa  224  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  44.67 
 
 
305 aa  224  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  44.79 
 
 
305 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  44.79 
 
 
305 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  44.79 
 
 
305 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  46.74 
 
 
300 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  44.79 
 
 
305 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  40.24 
 
 
325 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  44.33 
 
 
298 aa  222  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  44.98 
 
 
305 aa  221  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  47.64 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  47.64 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  43 
 
 
324 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  43 
 
 
324 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  45.21 
 
 
305 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  44.44 
 
 
305 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  43 
 
 
324 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  43 
 
 
324 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  43 
 
 
324 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  45.96 
 
 
304 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  43 
 
 
324 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  43 
 
 
324 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  43 
 
 
324 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  44.44 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  43.42 
 
 
304 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  44.17 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  43.64 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  44.17 
 
 
299 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  41.73 
 
 
256 aa  216  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  41.73 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  43.15 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  41.67 
 
 
324 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  41.67 
 
 
324 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  41.67 
 
 
324 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>