More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0784 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  100 
 
 
252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  50.7 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  48.5 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  47.84 
 
 
252 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  47.41 
 
 
252 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  47.41 
 
 
252 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  50 
 
 
235 aa  204  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  47.77 
 
 
252 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  47.41 
 
 
252 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  46.98 
 
 
252 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  45.65 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  47.39 
 
 
248 aa  194  9e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  46.93 
 
 
247 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  46.49 
 
 
247 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  46.32 
 
 
247 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  49.52 
 
 
263 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  45.09 
 
 
250 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  47 
 
 
268 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  47 
 
 
268 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  47 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  43.83 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  45.06 
 
 
260 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  45.06 
 
 
260 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  46.22 
 
 
249 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  42.99 
 
 
259 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  42.8 
 
 
255 aa  184  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  44.3 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  42.62 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  44.1 
 
 
260 aa  181  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  42.13 
 
 
268 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  41.46 
 
 
262 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  41.46 
 
 
279 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  42.98 
 
 
259 aa  178  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  43.35 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  42.13 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  39.08 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  40.16 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  40.09 
 
 
252 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  39.83 
 
 
270 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  41.23 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  38.52 
 
 
261 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  42.71 
 
 
286 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  40 
 
 
255 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  38.56 
 
 
287 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  37.65 
 
 
293 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  41.15 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  34.52 
 
 
278 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  42.78 
 
 
256 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  40.89 
 
 
245 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  42.08 
 
 
256 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  41.09 
 
 
264 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  38.22 
 
 
317 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  37.89 
 
 
254 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  36.21 
 
 
299 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  38.46 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  35.66 
 
 
290 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  34.3 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  36 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  38.12 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  38.12 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  38.42 
 
 
262 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  37.2 
 
 
255 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  34.44 
 
 
299 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.32 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.32 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  37.06 
 
 
263 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.32 
 
 
305 aa  125  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  35.29 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  35.29 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  35.29 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  35.29 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  35.32 
 
 
305 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  36.08 
 
 
305 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  38.3 
 
 
266 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.41 
 
 
288 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  34 
 
 
300 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  33.2 
 
 
305 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  33.86 
 
 
305 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  35.39 
 
 
304 aa  122  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  34.48 
 
 
278 aa  121  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  35.63 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  36.44 
 
 
321 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  35.81 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  36.76 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  35.71 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.1 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  38.5 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  35.43 
 
 
297 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  36.77 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  35.43 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  35.43 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  35.43 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  35.43 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  35.43 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  35.27 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  35.43 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  33.73 
 
 
304 aa  119  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  37.98 
 
 
270 aa  118  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  40.1 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  36.73 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>