More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3871 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  56.67 
 
 		 278 aa  299  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  53.65 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  48.86 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  47.95 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  41.6 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  41.67 
 
 		 253 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  41.47 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  42.86 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  40.64 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  40.64 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  40 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  40.62 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  41.04 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  41.31 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  40.4 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  37.74 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  40.24 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  40.24 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  41.49 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  37.96 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  39.04 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  39.11 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  40.78 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  38.89 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  37.74 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  41.67 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  39.22 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  39.22 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  37.92 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  41.67 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  40.14 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  37.78 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  40.14 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  40.23 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  39.85 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  35.87 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  38.87 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  40.51 
 
 		 262 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  42.04 
 
 		 249 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  38.82 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  40.85 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  38.06 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  36.63 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  38.46 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  38.19 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  36.51 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  37.17 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  35.54 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  35.66 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  37.86 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  36.62 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  35.06 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  34.27 
 
 		 248 aa  120  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  35.06 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  33.7 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  34.94 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  33.21 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  34.47 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4299  signal peptidase I  38.8 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  33.98 
 
 		 254 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  32.82 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  32.81 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  32.81 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  33.91 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  34 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  31.65 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  31.65 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  31.65 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  31.65 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  32.69 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  35 
 
 		 288 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  33.19 
 
 		 266 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  31.65 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  32.84 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  32.84 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  33.05 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  32.07 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.45 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  31.92 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.45 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.45 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  33.91 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  33.78 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  31 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.74 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.74 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.74 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  35.58 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.74 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  36.7 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  30.74 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  31.54 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  35.51 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  31.32 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  32.73 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  33.47 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.37 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  32.37 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  32.37 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>