More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0362 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  65.91 
 
 		 220 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  65.91 
 
 		 220 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  64.55 
 
 		 220 aa  288  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  64.55 
 
 		 220 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  65 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  65 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  63.18 
 
 		 220 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  63.64 
 
 		 220 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  58.82 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  56.36 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  54.42 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  51.57 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  53.54 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  51.35 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  52.7 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  50.47 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  43.17 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  44.14 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  42.73 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  46.83 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  40.1 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  39.18 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  40.4 
 
 		 198 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  35.84 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  35.84 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  37.62 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  37.62 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  35.75 
 
 		 253 aa  138  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  37.38 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.38 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  32.23 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  37.13 
 
 		 255 aa  134  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  38.03 
 
 		 299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  35.51 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  39.78 
 
 		 199 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  39.49 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  37.19 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  32.46 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  41.15 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  38.99 
 
 		 268 aa  128  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  37.11 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  37.27 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  38.53 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  37.27 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  37.25 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  38.1 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  38.39 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  36.84 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  36.12 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  37.5 
 
 		 305 aa  126  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  38.1 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  37.5 
 
 		 305 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  37.5 
 
 		 305 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  36.87 
 
 		 305 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  34.74 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  35.45 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  40.53 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  36.44 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  39.57 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  36.36 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  35.27 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  39.78 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  35.27 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  37.81 
 
 		 342 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  39.5 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  38.81 
 
 		 324 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  37.02 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  37.02 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  37.98 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  37.98 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  37.02 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  37.02 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  37.98 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  37.98 
 
 		 297 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  36.32 
 
 		 325 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  34.96 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  37.5 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  37.5 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  38.83 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  36.36 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  37.02 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  36.48 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  34.8 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  34.65 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  35.41 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  32.91 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  34.8 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  36.32 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  35.6 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  40.5 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  35.82 
 
 		 322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  34.48 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  35.41 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  35.41 
 
 		 284 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  38.67 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  35.82 
 
 		 322 aa  118  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  35.09 
 
 		 305 aa  118  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  35.41 
 
 		 284 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  33.06 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>