More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1864 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  98.26 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  84.78 
 
 		 230 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  50.45 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  49.52 
 
 		 245 aa  197  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  46.73 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  45.83 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  47.2 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  45.37 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  44.91 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  46.73 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  48.1 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  48.64 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  42.73 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  46.73 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  45.21 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  43.26 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  41.59 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  41.31 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  37.44 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  37.44 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  40.64 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  35.16 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  35.16 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  35.94 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  36.97 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  35.48 
 
 		 270 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.28 
 
 		 297 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.28 
 
 		 297 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.83 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  36.89 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  36.89 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  36.89 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  36.89 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  34.26 
 
 		 288 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  37.38 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  37.38 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  35.05 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  34.82 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  31.73 
 
 		 322 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  37.2 
 
 		 322 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  34.83 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  34.83 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  37.26 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  37.44 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  36.84 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  35.48 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  36.12 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  36.4 
 
 		 284 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.74 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  35.56 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  37 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  36.84 
 
 		 325 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  35.11 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  35.56 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  38.86 
 
 		 297 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  35.56 
 
 		 284 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  35.05 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  37.09 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  32.54 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  36.1 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  37.5 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  38.86 
 
 		 297 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  33.64 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  37.44 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  37.95 
 
 		 297 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  36.14 
 
 		 262 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.26 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  35.03 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  33.18 
 
 		 297 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  35.37 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  34.45 
 
 		 324 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  37.82 
 
 		 297 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.05 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  34.11 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  35.81 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  35.65 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  36.23 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  34.8 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  37.98 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  31.33 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  33.64 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  33.64 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  33.64 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  33.64 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  33.18 
 
 		 305 aa  121  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  32.46 
 
 		 324 aa  121  8e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  33.18 
 
 		 305 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  33.18 
 
 		 305 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  35.5 
 
 		 299 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  34.93 
 
 		 342 aa  121  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  35.12 
 
 		 298 aa  121  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>