More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0199 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  76.72 
 
 		 279 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  77.48 
 
 		 262 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  76.72 
 
 		 262 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  77.34 
 
 		 259 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  68.44 
 
 		 263 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  64.62 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  49.81 
 
 		 268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  49.62 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  49.06 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  49.8 
 
 		 249 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  48.33 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  47.96 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  49.25 
 
 		 245 aa  221  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  46.67 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  45.9 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  47.04 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  47.01 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  48.88 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  47.15 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  49.06 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  46.21 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  48.69 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  46.92 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  46.92 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  45.59 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  48.03 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  47.51 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  45.45 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  46.56 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  45.45 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  45.45 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  46.21 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  45.45 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  45.08 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  46.72 
 
 		 287 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  41.2 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  41.31 
 
 		 236 aa  186  5e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  45.34 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  43.64 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  43.87 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  40.88 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  42.74 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  40.15 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  40.7 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  42.86 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  42.99 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  40.76 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  38.52 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  37.64 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  37.25 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  44.44 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  38.82 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  38.98 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  40.17 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  38.25 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  37.64 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  40.17 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  40.69 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  40.55 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  38.02 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.29 
 
 		 305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  35.85 
 
 		 305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  35.09 
 
 		 305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  35.09 
 
 		 305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  35.09 
 
 		 305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  35.09 
 
 		 305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  38.53 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  33.09 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  38.24 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  39.82 
 
 		 299 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  38.63 
 
 		 262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  38.46 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  37.23 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.64 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.64 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.64 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  34.41 
 
 		 240 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.19 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  36.99 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  42.41 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  35.53 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  35.51 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  35.53 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  38.36 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  35.53 
 
 		 332 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  36.59 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  37.5 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  34.77 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  38.1 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  37.23 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  37.61 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  37.1 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>