More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4784 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  80.97 
 
 		 255 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  76.56 
 
 		 256 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  75 
 
 		 256 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  72.62 
 
 		 264 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  51.32 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  43.97 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  44.73 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  44.64 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  43.78 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  44.83 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  40.52 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  43.91 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  42.47 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  44.07 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  43.72 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  45.83 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  43.7 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  45.74 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  40.15 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  40.15 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  43.91 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  43.64 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  43.53 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  44.02 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  44.02 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  43.46 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  43.22 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  42.31 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  42.31 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  43.53 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  43.16 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  39.78 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  39.75 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  41.15 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  41.39 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  42.79 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  37.54 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  39.31 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  39.18 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  43.35 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  40.98 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  39.21 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  37.88 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  38.62 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  39.75 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  44.56 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  39.16 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  37.89 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  39.5 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  39.44 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  41.26 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  42.51 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  39.91 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  40.1 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  40.53 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  39.48 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  39.07 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  37.56 
 
 		 317 aa  131  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  40.1 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  38.89 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  40.28 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  41.51 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  37.73 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  37.27 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.25 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  38.96 
 
 		 305 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  37.86 
 
 		 288 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  39.6 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  39.6 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  37.01 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  42.08 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  37.5 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  37.5 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  37.5 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  37.5 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  36.29 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  39.04 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  36.29 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  37.01 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  36.29 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  37.13 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  37.01 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  37.01 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  38.6 
 
 		 305 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.55 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  39.11 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  36.12 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  36.95 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  35.12 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  36.12 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  37.91 
 
 		 284 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  39.38 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  40.4 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  38.03 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  40.29 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.14 
 
 		 305 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  40.4 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  36.89 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  41.67 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>