More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0374 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  47.81 
 
 		 268 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  51.39 
 
 		 253 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  52 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  51.6 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  50.8 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  51.2 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  50.8 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  51.61 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  49.8 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  52 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  48.24 
 
 		 268 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  48.24 
 
 		 268 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  48.24 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  49.81 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  49.81 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  49.8 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  48.65 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  49.03 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  47.66 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  47.98 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  47.98 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  48.41 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  51.05 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  50.2 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  47.18 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  47.76 
 
 		 249 aa  221  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  47.11 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  47.39 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  43.11 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  44.91 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  44.53 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  41.15 
 
 		 236 aa  186  5e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  39.56 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  44.26 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  40.67 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  42.91 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  40.88 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  43.75 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  43.04 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  41.25 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  40 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  39.83 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  38.95 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  41.15 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  39.68 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  41.07 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  40.43 
 
 		 256 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  40.35 
 
 		 317 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  42.2 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  40.64 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  39.64 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  36.52 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  36.36 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  41.15 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  36.57 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  43.6 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  36.74 
 
 		 305 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  39.46 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  41.28 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  38.87 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  38.87 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  39.67 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  42.93 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  42.93 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  41.35 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  39.37 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  37.66 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  36.95 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.84 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  36.12 
 
 		 305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  36.36 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  39.33 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  35.11 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  38.99 
 
 		 268 aa  132  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  39.73 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  35.56 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  32.78 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  32.78 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  39 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  32.78 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  35.27 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  38.74 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.99 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  37.61 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  37.61 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  36.07 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.99 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.99 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.99 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  37.9 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  38.53 
 
 		 268 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  32.37 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  38.62 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  40.38 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  35.39 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  37.86 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  37.86 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  37.86 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  36.73 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>